Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PDE7AQ13946 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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