Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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