Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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