Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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