Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms