Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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