Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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PRKAA1Q13131 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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PRKAA1Q13131 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PRKAA1Q13131 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PRKAA1Q13131 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PRKAA1Q13131 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PRKAA1Q13131 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PRKAA1Q13131 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKAA1Q13131 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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