Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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