Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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