Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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