Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms