Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLFN5Q08AF3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms