Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms