Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms