Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN11Q06124 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms