Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms