Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms