Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRX1P78414 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRX1P78414 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRX1P78414 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRX1P78414 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRX1P78414 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRX1P78414 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRX1P78414 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRX1P78414 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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