Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA4AP68366 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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