Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms