Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms