Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms