Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms