Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFX3P48380 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX3P48380 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms