Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT3P45378 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms