Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIPAP38571 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIPAP38571 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIPAP38571 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms