Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms