Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms