Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA1P25786 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms