Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GADD45AP24522 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms