Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAPN3P20807 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms