Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ATF3P18847 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF3P18847 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms