Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AP002807.1-203ENST00000534517 664 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC025287.4-201ENST00000640173 1240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC004918.3-201ENST00000602609 925 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC010834.3-201ENST00000520562 939 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC129507.2-201ENST00000572499 748 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms