Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms