Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMP4P12644 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms