Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMP1P11279 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms