Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB1P08034 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJB1P08034 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJB1P08034 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB1P08034 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms