Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBP07199 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPBP07199 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPBP07199 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPBP07199 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPBP07199 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBP07199 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBP07199 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBP07199 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms