Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms