Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATE1O95260 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATE1O95260 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATE1O95260 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATE1O95260 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATE1O95260 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATE1O95260 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATE1O95260 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ATE1O95260 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATE1O95260 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATE1O95260 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms