Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPFIA3O75145 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms