Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKAB2O43741 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms