Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODHO43272 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODHO43272 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms