Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms