Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf58C9J3I9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms