Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms