Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms