Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP3Q9Y6F1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP3Q9Y6F1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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