Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAI2Q9Y5P3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms