Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3M1Q9Y2T2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3M1Q9Y2T2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3M1Q9Y2T2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3M1Q9Y2T2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3M1Q9Y2T2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3M1Q9Y2T2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3M1Q9Y2T2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M1Q9Y2T2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms